什么是 FAT32？
FAT32 是 Microsoft 于 1996 年随 Windows 95 OSR2 推出的文件系统，是继 FAT12 和 FAT16 之后的最后一个未扩展的 FAT 文件系统。它主要用于早期的存储磁盘，NTFS 问世后，如今 FAT32 大多应用在闪存盘等小型固态存储设备上。
FAT 文件系统的核心是 File Allocation Table（文件分配表），它相当于索引表，用来记录驱动器内所有文件位置与空闲存储空间。FAT32 分区主要由以下几部分组成：
- 引导和其他保留扇区：存放引导指令、BIOS 参数块（含扇区总数）以及系统引导代码。
- FAT 1 和 FAT 2：FAT 1 是原始文件分配表，FAT 2 为备份副本。
- 根文件夹：记录分区根目录下文件/文件夹的名称、时间戳、启动簇、文件大小等信息。
- 其他文件夹和文件：存储分区内所有子目录、文件的相关数据。
FAT32 采用 32 位 FAT 条目划分分区簇状态，分为：未使用簇、损坏簇、已占用簇、文件末尾簇。
在 FAT32 中访问和存储文件
访问文件时，系统会读取文件分配表，依次检索连续簇编号，直至找到文件最后一个簇。FAT32 将子文件夹视作特殊文件，依靠文件分配表与目录数据，即可正常读取各级目录内的文件。
什么是 NTFS？
NTFS（新技术文件系统）首个版本发布于 1993 年，是 Windows NT 配套的磁盘文件系统。目前它已是 Windows 内置硬盘的默认文件系统，设计初衷就是弥补 FAT32 的各类缺陷。
NTFS 依靠 MFT 主文件表 作为索引，管理文件位置与空闲空间。NTFS 分区组成如下：
- NTFS 引导扇区：包含引导指令、BIOS 参数块与系统引导代码。
- 主文件表（MFT）：记录分区元数据以及所有文件的核心信息。
- 文件系统数据：存放无法存入 MFT 的大容量文件数据。
- 主文件表副本：用于故障恢复的 MFT 备份。
MFT 还会保存安全描述符、日志文件等丰富属性，支撑 NTFS 各项高级功能运行。
在 NTFS 中访问和存储文件
文件访问逻辑和 FAT32 类似，通过 MFT 与文件系统数据定位文件所在簇。NTFS 对文件夹做了优化：小型文件夹信息直接存入 MFT；大型文件夹采用 B 树结构管理，大幅提升检索与归类效率。
它们有何不同？
操作系统兼容性
FAT32 跨平台兼容性远优于 NTFS。NTFS 是微软专有格式，macOS 仅支持读取、无法写入；Linux 需借助第三方驱动（如 NTFS-3G）才能正常使用，且存在功能限制。
FAT32 几乎被所有主流、老旧系统原生支持，可正常读写，是多设备、多系统之间传输数据的首选。
卷和文件存储限制
FAT32 存在硬性容量限制：
- 单个文件最大：4 GB，传输超大文件会提示“文件过大”。
- 常规分区上限：多数系统仅支持 32 GB 及以下分区格式化为 FAT32；理论最大卷容量 16 TB。
NTFS 无此类限制，最大卷容量可达 8 PB（8192 TB），可存放超大文件与大容量分区。
容错能力
NTFS 属于日志型文件系统，修改数据前会先记录操作日志。遇到断电、系统崩溃等意外，可凭借日志回滚修复，数据安全性更高。
FAT32 无日志容错机制，异常断电极易造成文件损坏、分区表出错。
性能和速度
虽然日志机制看似会增加开销，但 NTFS 元数据（含 MFT）会在系统启动时载入缓存，实际读写效率很高。搭配 B 树目录结构，处理大量文件、大文件时，速度明显优于 FAT32。
文件压缩
NTFS 支持透明文件压缩，可单独压缩文件或整个目录，读取时按需解压，不影响日常使用。FAT32 不具备文件压缩功能。
安全特性
NTFS 集成两大安全功能：ACL 访问控制列表（精细化分配文件/文件夹权限）、EFS 加密文件系统（文件加密，仅持有密钥设备可访问）。FAT32 无任何原生安全权限与加密功能。
备份功能
NTFS 支持 VSS 卷影复制（卷快照），可给分区、文件创建快照备份，同时保留权限、链接等隐藏数据。FAT32 不支持该功能。
文件组织能力
NTFS 支持分区扩容/缩容、挂载分区、硬链接、符号链接、交界点等高级功能，文件与分区管理更灵活。FAT32 功能单一，文件组织能力较弱。
安装 Windows 系统时使用 NTFS 还是 FAT32？
安装 Windows 正式系统，优先选择 NTFS。
仅在制作 WinPE 维护盘、通用启动 U 盘场景下推荐 FAT32，依靠其强兼容性保证各类硬件正常引导。
若启动镜像单文件大于 4 GB，可先将 U 盘格式化为 FAT32 保证引导，再通过命令转换局部分区为 NTFS，兼顾兼容性与大文件存放需求。常规系统安装直接使用 NTFS 即可。
最后
综合来看 NTFS 综合体验更强，但部分场景仍适合使用 FAT32：
- 分区容量小于 512 MB：FAT32 占用空间开销更小，剩余可用空间更多。
- 移动存储设备：FAT32 / exFAT 跨设备兼容性最佳。
- 老旧系统环境：Windows 95、Windows 98 等旧系统仅支持 FAT 系列文件系统。
绝大多数现代使用场景（尤其是 512 MB 以上内置硬盘），NTFS 在稳定性、安全性、功能性上都是最优选择。
